菌落計數儀是微生物實驗中普遍使用的實驗儀器之一，是統計物品含菌數的有效設備，廣泛用于食品、飲料、藥品、生物制品、化妝品、衛生用品、飲用水、生活污水、工業廢水、臨床標本中細菌數的檢驗。
菌落計數儀的五大功能：
1.適用多種培養皿：適用于傳統的平板接種法、螺旋接種法等，培養皿直徑：標準的90mm和55mm。
2.光源
光源：長壽命的LED光源。光源組合：4種組合形式的光源和背景顏色。可選智能遙控多色光源背景，使計數不同種類及顏色的培養基更加準確。
3.成像
在成像方面，傳統的人工菌落計數儀采用放大鏡，放大倍數可達3至6倍。而全自動菌落計數器具有拍照功能，CCD的規格越來越高。現在銷售的HCC-90A型號像素為500萬，菌落分辨率：<0.1mm，圖像清晰度大大提高。
4.圖像處理
圖像處理功能，配套的軟件具有背景處理、顏色標記、干擾校正、菌落放大、面積計算等功能，這些都是傳統的菌落計數器所沒有的。
5.數據庫
在數據庫的處理方面，較傳統的菌落計數器，增加了數據存儲，智能查詢，數據導出等，有的還可以設置操作者使用權限，數據修改權限設置等，使測量的數據更加安全。同時，還可以在線編輯，報表打印。
